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All living organisms require nitrogen, and a single process biological nitrogen fixation accounts for more than 97% of natural nitrogen inputs into Earth s ecosystems. To date, most nitrogen fixation research has focused on the symbiotic nitrogen fixation occurring via the structured relationship of particular bacteria and plant roots. Yet free-living nitrogen fixation, the nitrogen fixation occurring outside of this symbiosis, may represent the dominant source of biologically-available nitrogen to a variety of ecosystems. Here we explored free-living nitrogen fixation controls, ranging from the effect of fertilization on nitrogen inputs to the role of microbial nitrogen-fixer community structure in regulating nitrogen fixation rates. We found that free-living nitrogen fixation was a dynamic process that supplied diverse ecosystems with nitrogen, and that we could elucidate multiple controls over this important process.